The removal and degradation pathways of microcystin-LR (MC-LR, [M+H]+=995.6) in UV-B photolysis and UV-B/H2O2 processes were examined using liquid chromatography-tandem mass spectrometry. The UV/H2O2 process was more efficient than UV-B photolysis for MC-LR removal. Eight by-products were newly identified in the UV-B photolysis ([M+H]+=414.3, 417.3, 709.6, 428.9, 608.6, 847.5, 807.4, and 823.6), and eleven by-products were identified in the UV-B/H2O2 process ([M+H]+=707.4, 414.7, 429.3, 445.3, 608.6, 1052.0, 313.4, 823.6, 357.3, 245.2, and 805.7). Most of the MC-LR by-products had lower [M+H]+ values than the MC-LR itself during both processes, except for the [M+H]+ value of 1052.0 during UV-B photolysis. Based on identified by-products and peak area patterns, we proposed potential degradation pathways during the two processes. Bond cleavage and intramolecular electron rearrangement by electron pair in the nitrogen atom were the major reactions during UV-B photolysis and UV-B/H2O2 processes, and hydroxylation by OH radical and the adduct formation reaction between the produced by-products were identified as additional pathways during the UV-B/H2O2 process. Meanwhile, the degradation by-products identified from MC-LR during UV-B/H2O2 process can be further degraded by increasing H2O2 dose.