Advanced oxidation processes (AOPs) are widely used for removal of taste and odor compounds and micropollutants. The major oxidation pathway of AOPs is the reaction of OH radical, which has high and non-selective reactivity with various substances. Due to the characteristics of OH radical, characterization of the background water matrix is very important for controlling AOPs, especially the concentration and characteristics of dissolved organic matter (DOM). Algal blooms can hinder the treatment of drinking water, including: reducing coagulation performance (Bernhardt et al., 1984), membrane fouling (Her et al., 2004), problems of taste and odor compounds (Lalezary et al., 1986; Li et al., 2012), and formation of disinfect by-products (Li et al., 2012). These problems relate to different characteristics of algogenic organic matter (AOM), which can scavenge the OH radical, with non-algae season. AOM derives from algae metabolic excretion (categorized as extracellular organic matter, EOM) and autolysis of cells in dead algae (categorized as intracellular organic matter, IOM), and it has various molecular weight distributions and functional groups. Her et al. (2004) reported that AOM can pass through the filtration process, thereby changing the characteristics of DOM at the post-filtration process as well. Consequently, there is a need to evaluate the reactivity between OH radical and AOM from various algae species.