Korea is always exposed to the problems of flood and drought as precipitation is concentrated during summer, even a slight climate change might cause serious water resource and water quality problems. As abnormal climate phenomena occur more often these days, there are increased interests in the effects of water quality and quantity of flow in rivers influenced by climate changes. Therefore, we should conduct researches on the influences of drought and flood caused by climate change brought on to the water system of the Nakdong River that became an enclosed water area as a result of constructing artificial structures like reservoirs, and also establish a systematic and comprehensive water quality management in terms of this. 
QUALKO2 models were used to analyze the change of water quality before and after the construction of weirs, this was due to control water level changes in the main course of the Nakdonggang River. As a result, it was found that the respective concentrations of BOD and chlorophyll A had increased by up to 37% and 81% respectively starting with the weir stations after the construction of weirs. In the case of chlorophyll A, its increase was found to be greatly affected by a stretch in the length of its stay, but in the case of algae, there are various limitation factors, thus it is determined that the exact analysis of this portion requires a validation of it through continuous field data in the future. When different methods of lowering the control water level had been simulated, it was ascertained that the respective concentrations of BOD and chlorophyll A decreased because of the flow velocity that increased in weir stations. Water quality changes caused by future climate change were analyzed by linking the SWAT models with the future runoff simulation results.