Water resources managements have become more important and essential to overcome global water crisis and security issues. Land-based water resources managements can disturb the balance of water budget in the downstream watershed. Subsequently, incoming freshwater will be changed in terms of both water quality and quantity, giving various impacts on coastal environments. Freshwater inputs to coastal ecosystems have been recognized as one of important key stressors.  Coastal ecosystems have become more important as a buffer or transition part in river-to-offshore ecological connectivity. However, there are limited concerns dealing this subject with the view of interdisciplinary cooperation or approach. Korea is one of the nation suffering from water scarcity. Recently, many management efforts have been performed to satisfy water resource needs. This paper summarize major issues and conflicts induced by water resource management efforts such as dam construction and river management. In Korea, many rivers and streams running into the ocean have been subject to high anthropogenic stressors such as river mouth dike construction and water city development. The land-to-ocean connectivity was affected by water management operations, giving controversies on ecosystem impacts by changed freshwater inputs. The damaged water connectivity could give adverse effects on ecological connectivity and also coastal ecosystem by changing incoming organic materials and forest-originated nutrients. Several case studies implied that there are few direct and urgent impacts on marine ecosystem. However, relatively long-term impacts are possible and any intensification or mitigation of expected impacts need to be also regarded together. Among oceanographic conditions, abnormal phenomena such as cold bottom water and coastal upwelling as well as ocean warming and sea level rise should be closely considered to interpret land-originated anthropogenic stressors. This paper indicate that multi scal