The ontogeny of an organism is very important ecological topic essential to understanding the population dynamics of the target organism and further the biological community where the species inhabit. However this topic is difficult to be demonstrated in the field and to need a lot of resources as a time-consuming work. Stable isotopes have been widely used to figure out a lot of ecological subjects. Especially, transition phases in aquatic organism and community have been successfully detected by stable isotope studies. Life history of an organism is composed of many different life stages possibly experiencing various ecological niches. Subsequently, the ontogenetic niche shifts of an target organism could be well examined by stable isotopes revealing its ecological traits such as potential primary food sources and species interactions at each life stage. This study reviewed recent studies on the ontogeny of marine benthic organisms to suggest the applicability of stable isotopes to examine life histories of benthic aquatic organisms. Abalone (Haliotis spp.) has two different life periods which are larval and benthic. During benthic period, abalone experience remarkably different benthic habitats which are crustose coralline algae (CCA) bed for early benthic life stages, red algae (mainly Gelidium sp.) bed for juvenile stage, and finally kelp bed for adult stage. Stable isotope studies have revealed that primary food sources have been shifted from egg yolk, benthic microalgae, red algae or small brown algae, and brown algae for larval, early juvenile, juvenile, and adult stages, respectively. The present results were well consistent with many previous experimental studies on the ontogeny of abalone. This study indicates that stable isotope ratios could be very promising tools to elucidate the ontogeny of benthic aquatic organisms in the field