Generation of reservoir by dam construction can be understood as the beginning of a new water system. By changing from lotic environment to reservoir environment, the big change is to occur in the aquatic environment. It is estimated that organic matter in the soil adsorption material or the like remaining in the submerged land will give a significant impact on water quality of water bodies of initial impoundment of dam. In this study, we examined in each land use by status, the impact on water quality due to soil elution from the submerged land in flooded soil water storage at the time due to dam construction. In this elution experiments, acrylic column was made to reproduce the water situation of early dam impoundment. Analysis item for measuring the change in water quality, water temperature, DO, pH, Conductivity is measured for basic water quality and COD, T-N, T-P was analyzed as the index item of water pollution. Soil was sampled by land use situation before it is submerged. And it is examined the effects of soil flooding on water quality in two different dissolved oxygen condition of overlying water, aerobic and anaerobic. 6 ~ 8 mg / L DO concentration in water, anaerobic conditions were performed to the dissolution test by dividing the state of 0 ~ 2 mg / L under aerobic conditions. Analysis has been focused on implementing the level of contribution of pollution sources and elution volume analysis of to the water body.