Merged MF-NF drinking water treatment system is composed of a pressurized microfiltration for turbidity removal, a nanofiltration for contaminants removal, and a submerged microfiltration for concentrate treatment. The system recovery rate is up to 95% in raw water at most. The pressurized microfiltration is operated 90% recovery and 568 ㎥/day. The nanofiltration consists of two-stage array. The water flux of the first and second stage nanofiltration are 266 ㎥/day and 33.5 ㎥/day, respectively. The submerged microfiltration treated the concentrate of the pressurized microfiltration. The submerged microfiltration are operated 90% recovery and 23 ㎥/day. The pressurized microfiltration without pretreatment was operated with 1.0 ㎥/㎡?day of water to control particulate matters i.e., turbidity. The water quality of permeate was 0.88-10.9 NTU of turbidity, 17-357 cells/mL of algae, 0.1-4.9 ㎍/L of chlorophyll-a. The trans-membrane pressure (TMP) of pressurized microfiltration was varied 0.46-0.95 kgf/㎠ (average: 0.63±0.13 kgf/㎠). The nanofiltration was installed to remove taste and odor. The TMP was 3.68±0.77 kgf/㎠ during operation. The influent pressure was increased from initial 3.04 kgf/㎠ to 5.37 kgf/㎠.  At the duration of taste and odor occurrence, the quality of 1st stage nanofiltration was that geosmin was 57.4±19.0 ng/L of feed water, but geosmin was not detected in permeate waters. The submerged microfiltration was operated with 0.5 ㎥/㎡?day. The TMP was varied with 0.132-0.486 kgf/㎠. The recovery and concentrate recirculation rate of NF process were controlled according to the concentration of taste, odor and TOC in raw and permeate water in this system. The adjustment of nanofiltration operation gives energy saving effects and good water quality.