물 자연 그리고 사람 - 물로 더 행복한 세상을 만들어가겠습니다.
HOME성과논문실적

논문실적

Complete genomic sequence analysis of norovirus isolated from South Korea 게시글의 제목, 학술지명, 저자, 발행일, 작성내용을 보여줌
Complete genomic sequence analysis of norovirus isolated from South Korea
학술지명 Virus Genes 저자 정규승,이찬희,이규철
발표일 2012-09-24

The complete nucleotide and deduced amino acid sequences of the RNA genome of a recently isolated norovirus (NoV) from Korea, designated Hu/GII-4/CBNU2/2007/KR (CBNU2), were determined and characterized by phylogenetic comparison with several genetically diverse NoV sequences. The RNA genome of CBNU2 was 7,560 nucleotides long, exclusive of the 3’ poly (A) tract, and included three open reading frames (ORFs): ORF1, encoding the nonstructural polyprotein (5-5,104); ORF2, encoding VP1 (5,085-6,707); and ORF3, encoding VP2 (6,707-7,513). ORF2-based phylogenetic analysis revealed that CBNU2 belonged to the GII.4 genotype, the most prevalent genotype, and formed a cluster with NoVs isolated from Asian regions, between 2006 and 2008. Comparative analysis with the consensus sequence from 207 completely sequenced NoV genomes showed 47 mismatched nucleotides: 26 in ORF1, 14 in ORF2, and 7 in ORF3, resulting in 8 amino acid changes: 3 in ORF1, 2 in ORF2, and 3 in ORF3. Phylogenetic analysis with full genome, ORF1, ORF2, and ORF3 nucleotide sequences obtained from CBNU2 and each of the other representative NoV genomes suggested that CBNU2 had not undergone recombination with any of the other NoVs. A SimPlot analysis further supported this finding.

목록