In developed countries, the modern goal of water policy is not only to preserve ecosystems, but also to rehabilitate them and restore their functions. However, since 1980s, rapidly increasing urban developments, industrial complexes, and population growth in Korea has caused degraded stream water and ecological disturbances. This, in turn, has resulted in a decrease in the diversity of freshwater fish (Lee, 2001). Although hydropower has its own merits in that it’s a so-called clean, renewable source of energy, along with current trends in pursuit of low-carbon emissions, it has direct and indirect impacts on river environment and fish habitats in terms of ecology (Scruton, et al., 2008). Outflow released from a dam, for example, to produce electricity may directly reduce or endanger specific fish downstream of a river (Hunter, 1992). When it comes to its indirect impacts, fish may move to another habitat, or benthic organisms serving as food for their predators may be exposed to a decrease or extinction, while some parts in a river get dried or wet depending on outflow (Cereghino and Lavandier, 1998).