A pilot test was carried out to investigate the long term operation characteristics of Microfiltration (MF) system as a pretreatment for seawater reverse osmosis (SWRO) processes for two years. A commercialized MF module with pressurized operation type was used to filter seawater to remove particles which can foul reverse osmosis (RO) membrane. Silt Density Index (SDI) values of filtered seawater by the MF system were ranged from 0.14 to 1.79, which meet the SDI standard for RO feed water as depicted in previous literatures. Although the tested seawater is quite clean (i.e., dissolved organic cabon (DOC) concentration and turbidity were about 1 mg/l and less than 1 NTU, respectively)  enough not to foul the MF membrane, steep increase in trans-membrane pressure (TMP) with a constant flux were observed over a whole operation period. A set of operation and water analysis data implies that the steep increase in TMP was resulted from iron and maganese fouling by the combination of metal corrosion by seawater and oxidation state by aeration and residual chlorine.