Because of monsoon climate creating intensive rainfall during summer, various development works such as weir and dam construction, bank revetment, and channelization have been performed in order to enhance efficiency of water supply and to control flood in Korea. These works may able to disturb aquatic environment of fish and reduce inhabitation range so that some sensitive species can have rapid decrease in population and in the worst case can be threatened with extinction. Recently, social concern about conservation and restoration of endangered species is grown more and more interested in importance of environmental quality, and local governments and research institutes perform fish restoration works. However, the efficiency is little due to insufficient data about ecological requirements (physical, chemical, and biological) of the species. Legally protected species which their habitat distribution has been declined in Korea are total 21 including 5 natural monument and 16 endangered species (Ⅰ, Ⅱ). Among them, Gobiobotia nakdongensis is the endangered species (Ⅰ), inhabit sandy-bottom stream, and restrictively distribute in Nakdong, Geum, and Imjin Rivers. In this study, they have been caught in Gam Stream, tributary of the Nakdong River, and aggregate dredging being done recently in the Gam Stream may cause habitat disturbance followed by habitat movement or decline in population. Therefore, fish investigations with cast net and kick net were performed in pre-, mid-, post dredging in order to determine any change in their habitat and population. In addition, water current and depth were measured in sites, Gobiobotia nakdongensis were found, and then substrate composition was classified through sieve analysis after samples were brought to a laboratory. Various requirements are in need to conserve and restore a specific species of fish in streams or rivers; physical (flow, current, depth, substrate, etc), chemical (pH, DO, nutrients, heavy metals, etc), and biological (food sources, prey and predator, riparian vegetation, etc). This study is to enhance efficiency of fish conservation and restoration in streams with understanding species-specific characteristics in habitat including protected species.