Giardia lamblia?a waterborne protozoan parasite?is well-known for causing giardiasis. G. lamblia exists in water systems at very low densities and is resistant to many environmental stresses, thereby necessitating the development of a very sensitive method for detecting viable G. lamblia. In this study, we newly designed 3 sets of primers and probes for the gene coding heat shock protein (hsp) 70, and we developed a real-time reverse transcription (RT)-polymerase chain reaction (PCR) method to detect the mRNA of the cytoplasmic hsp70 gene in order to detect viable G. lamblia. The real-time RT-PCR for hsp70 did not detect any mRNA when G. lamblia cysts were not stimulated by heat shock. However, it was shown that real-time RT-PCR for hsp70 could detect up to 10 cysts per sample when hsp70 mRNA was induced by heat shock. In conclusion, the real-time RT-PCR method for the hsp70 gene of G. lamblia that was developed in this study could detect 10 cysts per sample, thereby enabling the quantification of G. lamblia cysts. Further studies are required to detect both viable G. lamblia and Cryptosporidium parvum?an important waterborne parasite?by using duplex real-time RT-PCR.