The objective of this research is to develop an improved methodology for identifying optimal control rules that ensure the required level of service and allow the allocation of excess water for large conjunctive use systems. Through refinement of the existing operational rules, operated by the Korea Water Resources Corporation (Kwater) Operation Center (Kwater, 2007), an optimum balance between environmental impact or benefit, sustainable resources, drought reliable yield and electric power generation can be achieved, through allocation of water supply via a priority system dependent on storage levels in all reservoirs. For a reservoir operational policy, the historical results are used in this study. Using the actual data of both reservoir systems, monthly reservoir operational guide curves are derived by linear and non-linear regression analysis of the optimal set of releases, downstream lateral flows, and amounts of the trans-basin diversion. The optimal models such as SSDP for monthly target storage and SSDP-CoMOM for daily target storage were also used for identifying optimal control rules. The hydrologic states method in KModSim was used to represent the optimal control rules developed in this research. The operation of Kwater Reservoir Systems consisting of two reservoirs in Geum River basin was studied. However, during the development of the revised operational control rules the monetary cost of supply was not used as a parameter.