The anaerobic-intermittently aerobic (AIA) process was operated for the enhanced 
biological phosphorus and nitrogen removal over 2 years. A bench-scale AIA reactor 
operated in a continuous- flow anaerobic and alternating anoxic?aerobic mode was 
demonstrated to accomplish nitrification, denitrification, and phosphorus removal. 
Under the anaerobic zone, carbon source was taken up, polyhydroxyalkanoates (PHAs) were
 formed, and accomplished phosphorus release. The simultaneous phosphate uptake and
 denitrification by the denitrifying phosphate accumulating organisms (DePAOs) was 
observed even though the PHAs in cells were oxidized in the aerobic phase before the 
anoxic phase. Ammonium was oxidized to nitrate under the aerobic phase, and nitrate was 
reduced to nitrogen gas under the anoxic phase. As the nitrate concentration increased, 
phosphate uptake rate and denitrification rate decreased, whereas the release of phosphate  
was accelerated with the addition of the external carbon source. The 
secondary phos-phate release was not associated with the nitrate concentration, but was
 significantly related to the remained PHA concentration. The fraction of DePAOs among 
the entire phosphate accumulating organisms (PAOs) population was about 60 percent in 
the AIA  reactor. Results from the fluorescent in situ hybridization confirmed that 
Rhodocyclussp. was abundant in the AIA process, and Rhodocyclus-like organisms played 
major roles in the simultaneous phosphate uptake and denitrification under the anoxic 
condition, indicating the phosphate uptake under the anoxic phase was relatively slower 
than that under the aerobic phase.