Most of the surveys of periphyton carried out for environmental and ecosystem
health assessment of streams have considered the impact made on their fixative
substrates (stones, rocks, sand, silt, clay and other abiotic matters), but there has
been virtually no research that considered moving substrates. This study attempted
to make an analysis and assessment of the habitat environments of the microalgae
attached to the skin surfaces of fish living in small streams, with a focus on their
species composition and community structure. The dominant fish in the this survey
were Zacco temmincki and Zacco platypus, which are usually found in the streams,
and rivers, and they accounted for 62percentage and 19percentage, respectively, in 
relative abundance. Substrates of fish, a representative organism with the trait of 
moving a long distance, show a marked contrast with those of organisms fixed at a certain 
place. Characteristics of both the upstream and the downstream reach well reflected in the
 microalgae attached to the skin surface of fishes, of which diatoms took the major 
composition. The result of this observation is considered to be useful to provide basic 
data in assessment of stream health. Also it may be suggested as a biological tool for the 
assessment of aquatic environment in the future.